El estudio sobre la distribución y ecología de pequeños cetáceos en el archipiélago de Chiloé comenzó el año 2001, para ayudar a resolver algunas de las deficiencias más importantes en el conocimiento sobre delfines y marsopas, al menos a escala local. El proyecto se enfoca en el delfín chileno (Cephalorhynchus eutropia), delfín austral (Lagenorhynchus australis) y marsopa espinosa (Phocoena spinipinnis), pero también se registran otros mamíferos marinos y aves marinas. Los objetivos principales son; i) determinar la abundancia y los patrones de distribución de las dos especies de delfines, ii) identificar hábitats importantes para los pequeños cetáceos, asi como proporcionar recomendaciones para la gestión y ordenamiento territorial, iii) identificar las amenazas para las poblaciones locales de delfines y marsopas, y iv) mantener el primer estudio poblacional a largo plazo de pequeños cetáceos en el sur de Chile, que permitirá vigilar el estado de sus poblaciones y sus dinámicas.